RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420443.1

ARSEP1-201, Transcript of arylsulfatase E pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ARSEP1, Length 635 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARSEP1-201ENST00000420443 COL4A1P02462 1669 aa20.09■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 SULF1Q8IWU6 871 aa20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 MIER1Q8N108 512 aa20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 EYA3Q99504 573 aa20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ARSEP1-201ENST00000420443 GGA3Q9NZ52 723 aa20.08■□□□□ 0.81
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ARSEP1-201ENST00000420443 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.07■□□□□ 0.8
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ARSEP1-201ENST00000420443 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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ARSEP1-201ENST00000420443 CHL1O00533 1208 aa20.05■□□□□ 0.8
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ARSEP1-201ENST00000420443 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ARSEP1-201ENST00000420443 ZNF609O15014 1411 aa20.04■□□□□ 0.8
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ARSEP1-201ENST00000420443 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.04■□□□□ 0.8
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ARSEP1-201ENST00000420443 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20■□□□□ 0.79
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ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.94■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.94■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 HTTP42858 3142 aa19.94■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.94■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 USP17L3A6NCW0 530 aa19.93■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 USP17L4A6NCW7 530 aa19.93■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.93■□□□□ 0.78
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ARSEP1-201ENST00000420443 ATP2B4P23634 1241 aa19.9■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 GOLGA2Q08379 1002 aa19.9■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.9■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
ARSEP1-201ENST00000420443 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
ARSEP1-201ENST00000420443 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.89■□□□□ 0.77
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ARSEP1-201ENST00000420443 MYD88Q99836 296 aa19.89■□□□□ 0.77
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