RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GRM8O00222 908 aa26.12■■□□□ 1.77
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UBE2E3-201ENST00000392415 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.12■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.12■■□□□ 1.77
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UBE2E3-201ENST00000392415 XDHP47989 1333 aa26.11■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD17O75943 681 aa26.11■■□□□ 1.77
UBE2E3-201ENST00000392415 UFL1O94874 794 aa26.11■■□□□ 1.77
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UBE2E3-201ENST00000392415 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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UBE2E3-201ENST00000392415 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.05■■□□□ 1.76
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UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD14O00487 310 aa26.04■■□□□ 1.76
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UBE2E3-201ENST00000392415 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.04■■□□□ 1.76
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UBE2E3-201ENST00000392415 PSME4Q14997 1843 aa25.99■■□□□ 1.75
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2E3-201ENST00000392415 H7C1D1 291 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2E3-201ENST00000392415 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
UBE2E3-201ENST00000392415 MICALL2Q8IY33 904 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2E3-201ENST00000392415 SHTN1A0MZ66 631 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
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UBE2E3-201ENST00000392415 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
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UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1B0GUL6 1792 aa25.95■■□□□ 1.74
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UBE2E3-201ENST00000392415 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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UBE2E3-201ENST00000392415 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.93■■□□□ 1.74
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UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.92■■□□□ 1.74
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UBE2E3-201ENST00000392415 JMYQ8N9B5 988 aa25.92■■□□□ 1.74
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UBE2E3-201ENST00000392415 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L3A6NCW0 530 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L4A6NCW7 530 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF5LO75529 589 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ4P48050 445 aa25.91■■□□□ 1.74
UBE2E3-201ENST00000392415 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.91■■□□□ 1.74
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