RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PARP3Q9Y6F1 533 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MATN3O15232 486 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GAS2O43903 313 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRIM13O60858 407 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ONECUT2O95948 504 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MED14OSP0DP75 135 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LMO1P25800 156 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TXLNAP40222 546 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLP2Q04941 152 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IL22RA1Q8N6P7 574 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TTC9Q92623 222 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNK12Q9HB15 430 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CABP1Q9NZU7 370 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM170BA6NMN3 283 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NFKBIBQ15653 356 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCSK7Q16549 785 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SGO2Q562F6 1265 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HHIPL2Q6UWX4 724 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TBC1D32Q96NH3 1257 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PNMA5Q96PV4 448 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PALD1Q9ULE6 856 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ADMP35318 185 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GDF5P43026 501 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNQ4P56696 695 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GALNT11Q8NCW6 608 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PNMA1Q8ND90 353 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SASH1O94885 1247 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NFKB1P19838 968 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CD68P34810 354 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DUOXA2Q1HG44 320 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DUSP27Q5VZP5 1158 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNK4Q9NYG8 393 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LIMD1Q9UGP4 676 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GLI1P08151 1106 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GLDCP23378 1020 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CD96P40200 585 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CSRP2Q16527 193 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FYB2Q5VWT5 728 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANKRD34AQ69YU3 496 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PAOXQ6QHF9 649 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF575Q86XF7 245 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EGFRP00533 1210 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZAR1Q86SH2 424 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MISP3Q96FF7 219 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BDH2Q9BUT1 245 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SFI1A8K8P3 1242 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMTNP53814 917 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TCERG1LQ5VWI1 586 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FDX2Q6P4F2 183 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HFE2Q6ZVN8 426 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNN1Q92952 543 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VWCEQ96DN2 955 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EFCC1Q9HA90 598 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 USP3Q9Y6I4 520 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCSK5Q92824 1860 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C6P13671 934 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FEZF2Q8TBJ5 459 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EPS8L1Q8TE68 723 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBASH3BQ8TF42 649 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TYRO3Q06418 890 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM67Q5HYA8 995 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF765Q7L2R6 523 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSH2DQ96JZ2 352 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC01387J3KSC0 135 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CYR61O00622 381 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SEMA3FQ13275 785 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GSX2Q9BZM3 304 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ADAM7Q9H2U9 754 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EPB41L4BQ9H329 900 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRDM7Q9NQW5 492 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EML1O00423 815 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AMHP03971 560 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 INHAP05111 366 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AFMP43652 599 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GDF10P55107 478 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TXNDC11Q6PKC3 985 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.6 ms