RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PITX3-201ENST00000370002 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PITX3-201ENST00000370002 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PITX3-201ENST00000370002 GREM2Q9H772 168 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX3-201ENST00000370002 ATP2B4P23634 1241 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 UFL1O94874 794 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 CACNA1FO60840 1977 aa25.81■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 RIMBP2O15034 1052 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 ECE2O60344 883 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 ALDH1L1O75891 902 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 SLFN5Q08AF3 891 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 H7C1D1 291 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 F6X3S4 739 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 G3V3G9 751 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 PSMD14O00487 310 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 ITGA6P23229 1130 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 PODNQ7Z5L7 613 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 COL4A1P02462 1669 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 LTBP1Q14766 1721 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-201ENST00000370002 PTPRCP08575 1304 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 GRM8O00222 908 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 DOK7Q18PE1 504 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 TAF1P21675 1872 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 ZNF609O15014 1411 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 MED23Q9ULK4 1368 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 CNTNAP1P78357 1384 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 FOXO4P98177 505 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 MICALL2Q8IY33 904 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 FAM161AQ3B820 660 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 RASSF10A6NK89 507 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 MMP14P50281 582 aa25.7■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.7■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.7■■□□□ 1.71
PITX3-201ENST00000370002 UTYO14607 1347 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 COA1Q9GZY4 146 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 USP17L3A6NCW0 530 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 USP17L4A6NCW7 530 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 CHRNDQ07001 517 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 GMLQ99445 158 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 CST9Q5W186 159 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 MYH3P11055 1940 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX3-201ENST00000370002 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 SHTN1A0MZ66 631 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 VEGFBP49765 207 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 PCNTO95613 3336 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 TRAF5O00463 557 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 USP17L8P0C7I0 530 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 KCNJ4P48050 445 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms