RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ITSN1Q15811 1721 aa25.31■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 SNRKQ9NRH2 765 aa25.31■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.31■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.3■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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OPN3-201ENST00000366554 H3BQV1 296 aa25.29■■□□□ 1.64
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OPN3-201ENST00000366554 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.29■■□□□ 1.64
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OPN3-201ENST00000366554 NECTIN2Q92692 538 aa25.29■■□□□ 1.64
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OPN3-201ENST00000366554 A0A1B0GUL7 405 aa25.28■■□□□ 1.64
OPN3-201ENST00000366554 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.28■■□□□ 1.64
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OPN3-201ENST00000366554 SIRT1Q96EB6 747 aa25.26■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 PACS2Q86VP3 889 aa25.25■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 USP28Q96RU2 1077 aa25.25■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.23■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.23■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.23■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 HIP1O00291 1037 aa25.23■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.23■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 CCDC151A5D8V7 595 aa25.22■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 MLECQ14165 292 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 ATL3Q6DD88 541 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-201ENST00000366554 C3P01024 1663 aa25.22■■□□□ 1.63
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OPN3-201ENST00000366554 ZSCAN12O43309 604 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 FANCCQ00597 558 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 APOBRQ0VD83 1088 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 WDR24Q96S15 920 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 MED23Q9ULK4 1368 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-201ENST00000366554 BRD3Q15059 726 aa25.18■■□□□ 1.62
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