RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355091.8

GPAA1-201, Transcript of glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPAA1, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1-201ENST00000355091 LRP5O75197 1615 aa24.36■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 TMX3Q96JJ7 454 aa24.35■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 SPEF2Q9C093 1822 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 SCN7AQ01118 1682 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 KCNB2Q92953 911 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 ATP2B3Q16720 1220 aa24.33■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.33■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 CASZ1Q86V15 1759 aa24.33■■□□□ 1.49
GPAA1-201ENST00000355091 SSFA2P28290 1259 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 SCARF1Q14162 830 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.33■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TAF5LO75529 589 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CPA1P15085 419 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 GORABQ5T7V8 394 aa24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 MCM2P49736 904 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 COL4A1P02462 1669 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TRAK2O60296 914 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TTC14Q96N46 770 aa24.31■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 GNPATO15228 680 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 RPS6KA4O75676 772 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 PDE8BO95263 885 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 KCNJ4P48050 445 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.3■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TAF1P21675 1872 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 SLC27A2O14975 620 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 ERFEQ4G0M1 354 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 PI16Q6UXB8 463 aa24.29■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 NARFQ9UHQ1 456 aa24.28■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 CUL4AQ13619 759 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 PKP1Q13835 747 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 GBP4Q96PP9 640 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 C4BP0C0L5 1744 aa24.27■■□□□ 1.48
GPAA1-201ENST00000355091 ZAP70P43403 619 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 AK2P54819 239 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 SNAP23O00161 211 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 MYH7P12883 1935 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RTL9Q8NET4 1388 aa24.26■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 MCAMP43121 646 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 C4AP0C0L4 1744 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 FGFR2P21802 821 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ABCC12Q96J65 1359 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RUFY3Q7L099 469 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.23■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 VPS53Q5VIR6 699 aa24.23■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 RGL2O15211 777 aa24.22■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 PHKA1P46020 1223 aa24.22■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 TICAM2Q86XR7 235 aa24.22■■□□□ 1.47
GPAA1-201ENST00000355091 MAST3O60307 1309 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms