RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMC6Q7Z403 805 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YY1AP1Q9H869 796 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SASH3O75995 380 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATL3Q6DD88 541 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATG3Q9NT62 314 aa26.44■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A087WWV3 80 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BEND3Q5T5X7 828 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GORABQ5T7V8 394 aa26.43■■□□□ 1.82
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQUBQ8NA54 791 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAI1Q9UI46 699 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.43■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT32Q14532 448 aa26.42■■□□□ 1.82
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTR9Q6PD62 1173 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GOLGA5Q8TBA6 731 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JCADQ9P266 1359 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMC2O95347 1197 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIRT1Q96EB6 747 aa26.42■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MED23Q9ULK4 1368 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASQ1P31415 396 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXOC4Q96A65 974 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFNKQ9P0W0 207 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0D9SFI3 127 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AACSQ86V21 672 aa26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FSIP1Q8NA03 581 aa26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AK7Q96M32 723 aa26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LCMT1Q9UIC8 334 aa26.4■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EYA1Q99502 592 aa26.39■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.39■■□□□ 1.81
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.39■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEO1Q92859 1461 aa26.38■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EVCP57679 992 aa26.38■■□□□ 1.81
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.38■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP28Q96RU2 1077 aa26.38■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FLT4P35916 1363 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM2FA1L443 756 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FANCGO15287 622 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL17REQ8NFR9 667 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SBNO1A3KN83 1393 aa26.37■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEK1Q96PY6 1258 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FSD1Q9BTV5 496 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 METP08581 1390 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACEP12821 1306 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SDF4Q9BRK5 362 aa26.36■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ME1P48163 572 aa26.35■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXW7Q969H0 707 aa26.35■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.35■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZUG5 572 aa26.35■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.35■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOX12O15370 315 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CERS3Q8IU89 383 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABCC6O95255 1503 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAF5LO75529 589 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUT8Q9BYC5 575 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMX1Q9H3N1 280 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.34■■□□□ 1.81
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADAM21Q9UKJ8 722 aa26.34■■□□□ 1.81
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