RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 HTRA3P83110 453 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 CHADLQ6NUI6 762 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 POLLQ9UGP5 575 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 LTBP1Q14766 1721 aa23.01■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 RLBP1P12271 317 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 EPHX2P34913 555 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 CXCL9Q07325 125 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 SCNN1DP51172 638 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTX4-201ENST00000293922 LDHDQ86WU2 507 aa22.99■■□□□ 1.27
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PTX4-201ENST00000293922 PANK1Q8TE04 598 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 GREM2Q9H772 168 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.99■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 RTL9Q8NET4 1388 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 C6orf229H3BNL8 230 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 NEFLP07196 543 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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PTX4-201ENST00000293922 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.98■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 YDJCA8MPS7 323 aa22.97■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTX4-201ENST00000293922 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTX4-201ENST00000293922 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.95■■□□□ 1.26
PTX4-201ENST00000293922 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 GGA1Q9UJY5 639 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-201ENST00000293922 COG6Q9Y2V7 657 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 TNIP1Q15025 636 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTX4-201ENST00000293922 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTX4-201ENST00000293922 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 AAMPQ13685 434 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 MICALL2Q8IY33 904 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 JMYQ8N9B5 988 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 SCN9AQ15858 1988 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 MED23Q9ULK4 1368 aa22.83■■□□□ 1.25
PTX4-201ENST00000293922 G3V3G9 751 aa22.82■■□□□ 1.24
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