RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.86■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.86■■□□□ 1.73
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SNRNP25-201ENST00000293861 NTSR2O95665 410 aa25.85■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.84■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC12Q96J65 1359 aa25.84■■□□□ 1.73
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SNRNP25-201ENST00000293861 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.84■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.84■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.83■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF5LO75529 589 aa25.83■■□□□ 1.73
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.83■■□□□ 1.73
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SNRNP25-201ENST00000293861 RPS6KA4O75676 772 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 SSFA2P28290 1259 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 METTL24Q5JXM2 366 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 XAGE2Q96GT9 111 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM182BQ5T319 152 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF20Q5VTR2 975 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.82■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 PTMSP20962 102 aa25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNJ4P48050 445 aa25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.81■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLIM4O00461 696 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC27A2O14975 620 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNQ4P56696 695 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS53Q5VIR6 699 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP2B3Q16720 1220 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 GORABQ5T7V8 394 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.8■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 AK2P54819 239 aa25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 CASZ1Q86V15 1759 aa25.79■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM177BA6PVY3 158 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 ADORA1P30542 326 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 NARFQ9UHQ1 456 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 PSMA5P28066 241 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 RUFY3Q7L099 469 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.78■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.77■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE8BO95263 885 aa25.76■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 GNPATO15228 680 aa25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 TRAK2O60296 914 aa25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 PKP1Q13835 747 aa25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT32Q14532 448 aa25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 C4BP0C0L5 1744 aa25.74■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 CHGBP05060 677 aa25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 CPA1P15085 419 aa25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.73■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMA4Q16363 1823 aa25.72■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.72■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 ZPR1O75312 459 aa25.72■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.72■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 LPIN2Q92539 896 aa25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 NYXQ9GZU5 481 aa25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 FGFR2P21802 821 aa25.71■■□□□ 1.71
SNRNP25-201ENST00000293861 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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