RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 MCTP1Q6DN14 999 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 NARFQ9UHQ1 456 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 ATP5JP18859 108 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 NLRP10Q86W26 655 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 IL27Q8NEV9 243 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 FAM89AQ96GI7 184 aa21.82■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.81■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 AK2P54819 239 aa21.8■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.8■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.79■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 KCNB2Q92953 911 aa21.77■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.77■■□□□ 1.08
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USP18-201ENST00000215794 MSL1Q68DK7 614 aa21.74■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.74■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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USP18-201ENST00000215794 ZNF609O15014 1411 aa21.74■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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USP18-201ENST00000215794 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.73■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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USP18-201ENST00000215794 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.71■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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USP18-201ENST00000215794 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.71■■□□□ 1.07
USP18-201ENST00000215794 CCDC125Q86Z20 511 aa21.71■■□□□ 1.07
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