RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB22O15209 634 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA11-201ENST00000006015 ARID5BQ14865 1188 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA11-201ENST00000006015 PDIA6Q15084 440 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA11-201ENST00000006015 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXA11-201ENST00000006015 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXA11-201ENST00000006015 CTAGE5O15320 804 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 SLC20A2Q08357 652 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF790Q6PG37 636 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 EVI5LQ96CN4 794 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 MAP4K1Q92918 833 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 HIP1O00291 1037 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 HSPA2P54652 639 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 MST1RQ04912 1400 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 SLC27A2O14975 620 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ERICH4A6NGS2 130 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 PHKG2P15735 406 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 GSDMDP57764 484 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 RPS6KB1P23443 525 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 BECN2A8MW95 431 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 RESTQ13127 1097 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 L2HGDHQ9H9P8 463 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 KAZALD1Q96I82 304 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 SUCLG2Q96I99 432 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 SNRKQ9NRH2 765 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP45Q9UL16 551 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 USP16Q9Y5T5 823 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 MEGF6O75095 1541 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 TULP2O00295 520 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ALDH1L1O75891 902 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 CYP2C19P33261 490 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ST7Q9NRC1 585 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXA11-201ENST00000006015 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 ALS2Q96Q42 1657 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 GRM8O00222 908 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CYP27B1O15528 508 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 IGKV5-2P06315 115 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 ANO10Q9NW15 660 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 KIF1AQ12756 1690 aa23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 MTX1Q13505 466 aa23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 LINS1Q8NG48 757 aa23■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 PDE4CQ08493 712 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 COPS6Q7L5N1 327 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 TUBB4AP04350 444 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 FAM227BQ96M60 508 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 BRF1Q92994 677 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 GTF3C6Q969F1 213 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 SIL1Q9H173 461 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 H3BQV1 296 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 STK3Q13188 491 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 IFFO2Q5TF58 517 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 KCNJ6P48051 423 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CLCN6P51797 869 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC93Q567U6 631 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms