RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tom1l2Q5SRX1 507 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem87bQ8BKU8 555 aa24.55■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brpf1B2RRD7 1212 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Triml2E9PW10 424 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eya2O08575 532 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AaasP58742 546 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekhf1Q3TB82 279 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnq5Q9JK45 933 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pappa2E9PZ87 1789 aa24.54■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PgfP49764 158 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plbd2Q3TCN2 594 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CbarpQ66L44 698 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klf15Q9EPW2 415 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ecm29Q6PDI5 1840 aa24.53■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cwc27Q3TKY6 469 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atg9aQ68FE2 551 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zkscan8Q8BSL0 588 aa24.52■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Csrnp1P59054 583 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc51Q3URS9 406 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 WdpcpQ8C456 722 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa24.51■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp8a2P98200 1148 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ciao1Q99KN2 339 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa24.5■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Psme4Q5SSW2 1843 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pde8bE9Q4S1 865 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Psmd14O35593 310 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PdgfdQ925I7 370 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NinQ61043 2035 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Terf1P70371 421 aa24.48■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc4a9E9PUP3 929 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp8b2P98199 1209 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 GmpsQ3THK7 693 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptrh1Q8BW00 204 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ets1P27577 440 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhbdl3P58873 404 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fchsd1Q6PFY1 688 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Srgap3Q812A2 1099 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ParvgQ9ERD8 331 aa24.46■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp17lbE9Q9U0 468 aa24.45■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa24.45■■□□□ 1.51
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kifc2O08672 792 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmc2Q8R4P4 888 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbxo3Q9DC63 480 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dpp7Q9ET22 506 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnip1Q9WUU8 647 aa24.45■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Speer4dL7N216 212 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tspyl2Q7TQI8 677 aa24.44■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trpm7Q923J1 1863 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tm6sf1P58749 370 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm2163Q6PCY5 473 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scaf8Q6DID3 1268 aa24.42■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp2b3Q0VF55 1220 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nell2Q61220 819 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf18Q810A1 556 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem67Q8BR76 992 aa24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps12P63323 132 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gja3Q64448 417 aa24.39■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zbtb3Q91X45 518 aa24.39■■□□□ 1.5
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa24.39■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm46P86049 533 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SobpQ0P5V2 864 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EspnlQ3UYR4 1005 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf521Q6KAS7 1311 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NyxP83503 476 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc44a4Q91VA1 707 aa24.38■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4340L7N2C4 268 aa24.37■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Large2Q5XPT3 690 aa24.37■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myh15E9Q264 1925 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5592Q3V0A6 857 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DaglaQ6WQJ1 1044 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Glrx3Q9CQM9 337 aa24.36■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcc4E9Q236 1325 aa24.35■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nphp3Q7TNH6 1325 aa24.35■■□□□ 1.49
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd63A2ARS0 390 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms