RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.89□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa10.89□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.88□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.88□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 C11orf98E9PRG8 122 aa10.88□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa10.88□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 LRR1Q96L50 414 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 ASPNQ9BXN1 380 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 REEP1Q9H902 201 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 SELENONQ9NZV5 590 aa10.87□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 CMAHPQ9Y471 501 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 U3KQV3 271 aa10.87□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 ZNF726A6NNF4 738 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 E2F6O75461 281 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 GADD45GO95257 159 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 ADORA3P0DMS8 318 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 THRBP10828 461 aa10.86□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 PEX2P28328 305 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 GIPRP48546 466 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 CHN2P52757 468 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 BIDP55957 195 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 SMIM11AP58511 58 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 ST3GAL3Q11203 375 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 RAB39AQ14964 217 aa10.86□□□□□ -0.67
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PRAME-212ENST00000485532 TRAM2Q15035 370 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 SEC23BQ15437 767 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 FGD3Q5JSP0 725 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 LRRC17Q8N6Y2 441 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 SCAIQ8N9R8 606 aa10.86□□□□□ -0.67
PRAME-212ENST00000485532 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.86□□□□□ -0.67
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