RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MXE2 369 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf98E9PRG8 122 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 H0YAE9 185 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 M0R082 166 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 AKR7A3O95154 331 aa10.16□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.16□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 FREM3P0C091 2139 aa10.16□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-209ENST00000590049 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.15□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa10.15□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 RASD1Q9Y272 281 aa10.15□□□□□ -0.78
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CAPNS1-209ENST00000590049 AQP7P3A6NL99 342 aa10.14□□□□□ -0.79
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC16A6O15403 523 aa10.14□□□□□ -0.79
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CAPNS1-209ENST00000590049 MED21Q13503 144 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 PGGHGQ32M88 737 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 C1QL4Q86Z23 238 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM99Q8N816 258 aa10.14□□□□□ -0.79
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