RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488137.5

C1orf109-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-208ENST00000488137 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CA10Q9NS85 328 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 TAS2R1Q9NYW7 299 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 F8P00451 2351 aa11.49□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SH3PXD2BA1X283 911 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 OVOL3O00110 214 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CDC42EP2O14613 210 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ATP5HO75947 161 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CD14P08571 375 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FOSL1P15407 271 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 LIMS1P48059 325 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 GIPRP48546 466 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RPS6KA3P51812 740 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 PLP2Q04941 152 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 PIGFQ07326 219 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 WDFY1Q8IWB7 410 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FANK1Q8TC84 345 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 Q96MF0 132 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 KCNK17Q96T54 332 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 THTPAQ9BU02 230 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 BDH2Q9BUT1 245 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF442Q9H7R0 627 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ARID1AO14497 2285 aa11.48□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 PLCE1Q9P212 2302 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 UNC119BA6NIH7 251 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 AHCYL1O43865 530 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SLC2A10O95528 541 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CELA3BP08861 270 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FUT4P22083 530 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FPR3P25089 353 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SDHAP31040 664 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 OMPP47874 163 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RASSF2P50749 326 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RUNX1T1Q06455 604 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 FMODQ06828 376 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 DAG1Q14118 895 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RAB35Q15286 201 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 VHLLQ6RSH7 139 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SMARCD3Q6STE5 483 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ADCK1Q86TW2 530 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF519Q8TB69 540 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 NSMAFQ92636 917 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 C18orf12Q96KH6 178 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SIAEQ9HAT2 523 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 NOX3Q9HBY0 568 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 MED13LQ71F56 2210 aa11.47□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 A0A1W2PPL8 197 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 B9A039 149 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 H7C417 338 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 EBAG9O00559 213 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SERPINA5P05154 406 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 NOS3P29474 1203 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 CALCRP30988 508 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SLC6A6P31641 620 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SERPINF1P36955 418 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 MAGEA2P43356 314 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 NUDT6P53370 316 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 ERVK-25P63136 954 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 HSF2Q03933 536 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SEC23BQ15437 767 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 IQCCQ4KMZ1 466 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 SKA3Q8IX90 412 aa11.46□□□□□ -0.57
C1orf109-208ENST00000488137 LRRC18Q8N456 261 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms