RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	CTXN1	P60606	82 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	RAB1A	P62820	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	RAB35	Q15286	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ETFDH	Q16134	617 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	NUP37	Q8NFH4	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ABCA1	O95477	2261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876		H7C1C5	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	GMNN	O75496	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	UBL3	O95164	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF35	P13682	527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	RHCE	P18577	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	SLC9A3	P48764	834 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF84	P51523	738 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	LCN6	P62502	163 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	CHRNB3	Q05901	458 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	CD47	Q08722	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	DAG1	Q14118	895 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	DGCR6	Q14129	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	NSMAF	Q92636	917 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	PYURF	Q96I23	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPSA-208	ENST00000487876	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876		B2RBV5	119 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	PDE5A	O76074	875 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	CCL2	P13500	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	ATP6V1B2	P21281	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	NR4A1	P22736	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	OMP	P47874	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	LIMS1	P48059	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	ERVK-25	P63136	954 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	EFNB3	Q15768	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	CDK20	Q8IZL9	346 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	GPA33	Q99795	319 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	REG4	Q9BYZ8	158 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	PLK3	Q9H4B4	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876		A0A096LNT2	108 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876		B9A039	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	SERPINA5	P05154	406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	NPR2	P20594	1047 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	EFNA4	P52798	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	SPIB	Q01892	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	TAF11	Q15544	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	MEST	Q5EB52	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPSA-208	ENST00000487876	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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