RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	SNX6	Q9UNH7	406 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	GINS2	Q9Y248	185 aa		3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PTPRJ	Q12913	1337 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361		A0A0U1RRA0	63 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361		L7N2F9	121 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MYL12B	O14950	172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MED7	O43513	233 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PLIN3	O60664	434 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SC5D	O75845	299 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	KRT33A	O76009	404 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	STBD1	O95210	358 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NDUFB10	O96000	172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	APOC2	P02655	101 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PCCB	P05166	539 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CSF3	P09919	207 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZNF806	P0C7X5	589 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC2A1	P11166	492 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HPGD	P15428	266 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CD1E	P15812	388 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SPI1	P17947	270 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MYL12A	P19105	171 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TPSB2	P20231	275 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HTR1E	P28566	365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SDC2	P34741	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RFC2	P35250	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ELK3	P41970	407 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MAGEA2	P43356	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RGS6	P49758	472 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TNFSF10	P50591	281 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC7A2	P52569	658 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ACLY	P53396	1101 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CDH6	P55285	790 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AP3S2	P59780	193 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DNAJB13	P59910	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CUL2	Q13617	745 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PON2	Q15165	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PON3	Q15166	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TPSAB1	Q15661	275 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	IL17A	Q16552	155 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	AANAT	Q16613	207 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	UBE2S	Q16763	222 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYP51A1	Q16850	503 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DDI2	Q5TDH0	399 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MLIP	Q5VWP3	458 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SNX20	Q7Z614	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	COMMD7	Q86VX2	200 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RNF130	Q86XS8	419 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	NAXD	Q8IW45	347 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	TMEM99	Q8N816	258 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	RNF149	Q8NC42	400 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		3.2	□□□□□ -1.9
QKI-213	ENST00000544361	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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