RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL2	P13500	99 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ARFIP2	P53365	341 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM33	P57088	247 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PMS2P3	Q13401	168 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MIER2	Q8N344	545 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6S1	Q8NH40	331 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPN	Q9BXN1	380 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf98	E9PRG8	122 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	UBD	O15205	165 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINA5	P05154	406 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRA2C	P18825	462 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	AHCY	P23526	432 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	AQP1	P29972	269 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH12	P55289	794 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	BID	P55957	195 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	NCALD	P61601	193 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL8	P80075	99 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK6	Q00534	326 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf56	Q8N813	242 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM54	Q969K7	222 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	EPYC	Q99645	322 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A7	Q99884	636 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ESM1	Q9NQ30	184 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG2	Q9Y698	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TG	P01266	2768 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF726	A6NNF4	738 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ADORA3	P0DMS8	318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MVK	Q03426	396 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MELK	Q14680	651 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	NPTX1	Q15818	432 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5J2	Q8NH18	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	GLTP	Q9NZD2	209 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R3H8	397 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPP2	O43688	288 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPD3	O95274	346 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	MPZL1	O95297	269 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV2-5	P01817	119 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	THY1	P04216	161 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PGA4	P0DJD7	388 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PGA3	P0DJD8	388 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF250	P15622	560 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78

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