RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PMS2P2O95744 297 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TAS2R19P59542 299 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SHC2P98077 582 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 BDH1Q02338 343 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PLA2G7Q13093 441 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 IRF5Q13568 498 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PDGFRLQ15198 375 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PMM1Q92871 262 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 HAVCR1Q96D42 359 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GPER1Q99527 375 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 OR1A2Q9Y585 309 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 LEFTY2O00292 366 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 OR2F2O95006 317 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 G0S2P27469 103 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 DHRS2Q13268 280 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 OR2F1Q13607 317 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 DUSP5Q16690 384 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 Q499Y3 187 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ACTBL2Q562R1 376 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ULK3Q6PHR2 472 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 HHIPQ96QV1 700 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 CACNA1DQ01668 2161 aa14.92□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A0A0A6YYH2 397 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TSPAN11A1L157 253 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A6NJ64 397 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TNFSF12O43508 249 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GAS1P54826 345 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A0A0G2JK05 382 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 CTXN1P60606 82 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 BMPERQ8N8U9 685 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 FIBINQ8TAL6 211 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GPR148Q8TDV2 347 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 CWH43Q9H720 699 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A0A1B0GV90 55 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A0A1W2PPH5 198 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 C2orf74A8MZ97 194 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 JMJD7P0C870 316 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GLI4P10075 376 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 MAOAP21397 527 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ADH6P28332 368 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 EFNB2P52799 333 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 C4orf17Q53FE4 359 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ALG12Q9BV10 488 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.91□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 A0A087WV48 116 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 NME2P1O60361 137 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 YIF1AO95070 293 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 THEGLP0DJG4 465 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ST6GAL1P15907 406 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SERPINF1P36955 418 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 RNF212Q495C1 297 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SLAMF9Q96A28 289 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 MIB2Q96AX9 1013 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ADAM11O75078 769 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 ZNF44P15621 663 aa14.9□□□□□ -0.02
GPC1-201ENST00000264039 RPA2P15927 270 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms