RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrnnD3YUU6 520 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930451I11RikE9Q9R3 111 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prr22F6TNE3 422 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NnmtO55239 264 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bmp8aP34821 399 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elk1P41969 429 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cuzd1P70412 606 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10644Q3TZG3 87 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HepacamQ640R3 418 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem158Q6F5E0 286 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prkd2Q8BZ03 875 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r192Q8K4C9 300 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccm2lQ8VCC6 481 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Shisa5Q9D7I0 235 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mfsd2aQ9DA75 534 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tlr1Q9EPQ1 795 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Copz2Q9JHH9 205 aa13.6□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r9A2RST7 299 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r137D3YTY1 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r143E9PUW9 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp712E9PXJ4 705 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r157E9Q069 297 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp995E9Q6M3 437 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r112G3UY48 297 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FaimlJ3QPY3 178 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r135K9J7G0 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r125L7N227 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r116L7N2A6 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klk1b26P36369 261 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rfx3P48381 749 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf133Q14B02 382 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1286Q7TQY2 305 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CslQ80X68 466 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb26Q8C8S0 451 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr668Q8VGW3 318 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Coq5Q9CXI0 327 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pfn4Q9D6I3 129 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r100Q9EPS5 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lao1B1ARV3 523 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fcn2O70497 314 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nkx2-6P43688 289 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dag1Q62165 893 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnc3Q63959 769 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa-rs10Q64263 91 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il11ra1Q64385 432 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc6a7Q6PGE7 637 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ticam1Q80UF7 732 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abhd13Q80UX8 337 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tns4Q8BZ33 696 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr922Q8VG50 311 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Emc4Q9CZX9 183 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dusp12Q9D0T2 339 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uchl1Q9R0P9 223 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Deaf1Q9Z1T5 566 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sdk2Q6V4S5 2176 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hmgn2P09602 90 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpr143P70259 405 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrfn1Q2WF71 766 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr11Q3V1L6 700 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plpp1Q61469 283 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxl1Q64731 336 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DdiasQ6NZG4 898 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kyat3Q71RI9 455 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1163Q8VFR4 316 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snapc3Q9D2C9 407 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akr1e2Q9DCT1 301 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Oasl2Q9Z2F2 508 aa13.59□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv16-1A0A0A6YW39 117 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lcn11A2BHR2 178 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clec10aP49300 304 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr18Q0VAX9 331 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Swi5Q8K3D3 89 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ocel1Q8VCR9 219 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NwcQ9CQI4 244 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gdpd1Q9CRY7 314 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EqtnQ9D9V2 337 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fstl3Q9EQC7 256 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcea2Q9QVN7 299 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gstz1Q9WVL0 216 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Frem2Q6NVD0 3160 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trabd2bB1ATG9 517 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Btbd8D3YUB6 377 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm8159E9Q0R1 267 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr66F8VQ01 311 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Susd5G3UW60 619 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctla4P09793 223 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr75Q3U821 830 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd47Q61735 303 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp184Q7TSH9 737 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tgm4Q8BZH1 670 aa13.58□□□□□ -0.24
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Saysd1Q8K190 188 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.5 ms