Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXI0

Coq5, 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial, mousemouse

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Length 327 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coq5Q9CXI0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Coq5Q9CXI0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Coq5Q9CXI0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Coq5Q9CXI0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Coq5Q9CXI0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Coq5Q9CXI0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Coq5Q9CXI0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Coq5Q9CXI0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Coq5Q9CXI0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Coq5Q9CXI0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Coq5Q9CXI0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Coq5Q9CXI0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Coq5Q9CXI0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Coq5Q9CXI0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Coq5Q9CXI0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Coq5Q9CXI0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Coq5Q9CXI0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Coq5Q9CXI0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Coq5Q9CXI0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Coq5Q9CXI0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Coq5Q9CXI0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Coq5Q9CXI0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Coq5Q9CXI0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Coq5Q9CXI0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Coq5Q9CXI0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Coq5Q9CXI0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Coq5Q9CXI0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Coq5Q9CXI0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Coq5Q9CXI0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Coq5Q9CXI0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Coq5Q9CXI0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Coq5Q9CXI0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Coq5Q9CXI0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Coq5Q9CXI0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Coq5Q9CXI0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Coq5Q9CXI0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Coq5Q9CXI0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Coq5Q9CXI0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Coq5Q9CXI0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Coq5Q9CXI0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Coq5Q9CXI0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Coq5Q9CXI0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Coq5Q9CXI0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Coq5Q9CXI0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Coq5Q9CXI0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Coq5Q9CXI0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Coq5Q9CXI0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Coq5Q9CXI0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Coq5Q9CXI0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Coq5Q9CXI0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Coq5Q9CXI0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Coq5Q9CXI0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Coq5Q9CXI0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Coq5Q9CXI0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Coq5Q9CXI0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Coq5Q9CXI0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Coq5Q9CXI0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Coq5Q9CXI0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Coq5Q9CXI0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Coq5Q9CXI0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Coq5Q9CXI0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Coq5Q9CXI0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Coq5Q9CXI0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Coq5Q9CXI0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Coq5Q9CXI0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Coq5Q9CXI0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Coq5Q9CXI0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Coq5Q9CXI0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Coq5Q9CXI0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Coq5Q9CXI0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Coq5Q9CXI0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Coq5Q9CXI0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Coq5Q9CXI0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Coq5Q9CXI0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Coq5Q9CXI0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Coq5Q9CXI0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Coq5Q9CXI0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Coq5Q9CXI0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Coq5Q9CXI0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Coq5Q9CXI0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Coq5Q9CXI0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Coq5Q9CXI0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Coq5Q9CXI0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Coq5Q9CXI0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Coq5Q9CXI0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Coq5Q9CXI0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Coq5Q9CXI0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Coq5Q9CXI0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Coq5Q9CXI0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Coq5Q9CXI0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Coq5Q9CXI0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Coq5Q9CXI0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Coq5Q9CXI0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Coq5Q9CXI0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Coq5Q9CXI0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Coq5Q9CXI0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Coq5Q9CXI0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Coq5Q9CXI0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Coq5Q9CXI0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Coq5Q9CXI0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms