Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Trabd2bB1ATG9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Trabd2bB1ATG9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Trabd2bB1ATG9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Trabd2bB1ATG9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Trabd2bB1ATG9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trabd2bB1ATG9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trabd2bB1ATG9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Trabd2bB1ATG9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trabd2bB1ATG9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Trabd2bB1ATG9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Trabd2bB1ATG9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trabd2bB1ATG9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trabd2bB1ATG9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trabd2bB1ATG9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Trabd2bB1ATG9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trabd2bB1ATG9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trabd2bB1ATG9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trabd2bB1ATG9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trabd2bB1ATG9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trabd2bB1ATG9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trabd2bB1ATG9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Trabd2bB1ATG9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trabd2bB1ATG9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trabd2bB1ATG9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trabd2bB1ATG9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trabd2bB1ATG9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trabd2bB1ATG9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trabd2bB1ATG9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trabd2bB1ATG9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trabd2bB1ATG9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trabd2bB1ATG9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trabd2bB1ATG9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trabd2bB1ATG9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trabd2bB1ATG9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trabd2bB1ATG9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trabd2bB1ATG9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trabd2bB1ATG9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trabd2bB1ATG9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trabd2bB1ATG9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trabd2bB1ATG9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trabd2bB1ATG9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trabd2bB1ATG9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trabd2bB1ATG9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trabd2bB1ATG9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trabd2bB1ATG9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trabd2bB1ATG9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trabd2bB1ATG9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trabd2bB1ATG9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trabd2bB1ATG9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Trabd2bB1ATG9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trabd2bB1ATG9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trabd2bB1ATG9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trabd2bB1ATG9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trabd2bB1ATG9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trabd2bB1ATG9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trabd2bB1ATG9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trabd2bB1ATG9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trabd2bB1ATG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trabd2bB1ATG9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trabd2bB1ATG9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trabd2bB1ATG9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trabd2bB1ATG9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trabd2bB1ATG9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trabd2bB1ATG9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trabd2bB1ATG9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trabd2bB1ATG9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trabd2bB1ATG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trabd2bB1ATG9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trabd2bB1ATG9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trabd2bB1ATG9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trabd2bB1ATG9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trabd2bB1ATG9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trabd2bB1ATG9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trabd2bB1ATG9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trabd2bB1ATG9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trabd2bB1ATG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trabd2bB1ATG9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trabd2bB1ATG9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trabd2bB1ATG9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trabd2bB1ATG9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trabd2bB1ATG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trabd2bB1ATG9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trabd2bB1ATG9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trabd2bB1ATG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trabd2bB1ATG9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trabd2bB1ATG9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trabd2bB1ATG9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trabd2bB1ATG9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trabd2bB1ATG9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trabd2bB1ATG9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trabd2bB1ATG9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trabd2bB1ATG9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trabd2bB1ATG9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trabd2bB1ATG9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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