Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Gdpd1Q9CRY7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gdpd1Q9CRY7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gdpd1Q9CRY7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gdpd1Q9CRY7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gdpd1Q9CRY7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gdpd1Q9CRY7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gdpd1Q9CRY7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gdpd1Q9CRY7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gdpd1Q9CRY7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gdpd1Q9CRY7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gdpd1Q9CRY7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd1Q9CRY7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gdpd1Q9CRY7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gdpd1Q9CRY7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gdpd1Q9CRY7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gdpd1Q9CRY7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gdpd1Q9CRY7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gdpd1Q9CRY7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gdpd1Q9CRY7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gdpd1Q9CRY7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gdpd1Q9CRY7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gdpd1Q9CRY7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gdpd1Q9CRY7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gdpd1Q9CRY7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gdpd1Q9CRY7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gdpd1Q9CRY7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gdpd1Q9CRY7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gdpd1Q9CRY7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gdpd1Q9CRY7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gdpd1Q9CRY7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gdpd1Q9CRY7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gdpd1Q9CRY7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gdpd1Q9CRY7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gdpd1Q9CRY7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gdpd1Q9CRY7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gdpd1Q9CRY7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gdpd1Q9CRY7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gdpd1Q9CRY7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gdpd1Q9CRY7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd1Q9CRY7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd1Q9CRY7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gdpd1Q9CRY7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gdpd1Q9CRY7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gdpd1Q9CRY7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gdpd1Q9CRY7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gdpd1Q9CRY7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gdpd1Q9CRY7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gdpd1Q9CRY7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gdpd1Q9CRY7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gdpd1Q9CRY7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gdpd1Q9CRY7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gdpd1Q9CRY7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gdpd1Q9CRY7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gdpd1Q9CRY7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gdpd1Q9CRY7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gdpd1Q9CRY7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gdpd1Q9CRY7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdpd1Q9CRY7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gdpd1Q9CRY7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gdpd1Q9CRY7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gdpd1Q9CRY7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gdpd1Q9CRY7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gdpd1Q9CRY7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gdpd1Q9CRY7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gdpd1Q9CRY7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gdpd1Q9CRY7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdpd1Q9CRY7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gdpd1Q9CRY7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdpd1Q9CRY7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gdpd1Q9CRY7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdpd1Q9CRY7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdpd1Q9CRY7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdpd1Q9CRY7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdpd1Q9CRY7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdpd1Q9CRY7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd1Q9CRY7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gdpd1Q9CRY7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd1Q9CRY7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd1Q9CRY7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd1Q9CRY7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd1Q9CRY7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdpd1Q9CRY7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd1Q9CRY7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdpd1Q9CRY7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdpd1Q9CRY7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdpd1Q9CRY7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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