Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Tlr1Q9EPQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tlr1Q9EPQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tlr1Q9EPQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tlr1Q9EPQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tlr1Q9EPQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tlr1Q9EPQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tlr1Q9EPQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tlr1Q9EPQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlr1Q9EPQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlr1Q9EPQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlr1Q9EPQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tlr1Q9EPQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlr1Q9EPQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlr1Q9EPQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr1Q9EPQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tlr1Q9EPQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tlr1Q9EPQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tlr1Q9EPQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tlr1Q9EPQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tlr1Q9EPQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tlr1Q9EPQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tlr1Q9EPQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tlr1Q9EPQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tlr1Q9EPQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tlr1Q9EPQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tlr1Q9EPQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tlr1Q9EPQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tlr1Q9EPQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr1Q9EPQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlr1Q9EPQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlr1Q9EPQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr1Q9EPQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr1Q9EPQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr1Q9EPQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tlr1Q9EPQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr1Q9EPQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr1Q9EPQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr1Q9EPQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tlr1Q9EPQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr1Q9EPQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tlr1Q9EPQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tlr1Q9EPQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tlr1Q9EPQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr1Q9EPQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tlr1Q9EPQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tlr1Q9EPQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tlr1Q9EPQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tlr1Q9EPQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr1Q9EPQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr1Q9EPQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr1Q9EPQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr1Q9EPQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr1Q9EPQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr1Q9EPQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr1Q9EPQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tlr1Q9EPQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tlr1Q9EPQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tlr1Q9EPQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tlr1Q9EPQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tlr1Q9EPQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr1Q9EPQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tlr1Q9EPQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tlr1Q9EPQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tlr1Q9EPQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tlr1Q9EPQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tlr1Q9EPQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr1Q9EPQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr1Q9EPQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr1Q9EPQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr1Q9EPQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr1Q9EPQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr1Q9EPQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr1Q9EPQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr1Q9EPQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tlr1Q9EPQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr1Q9EPQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr1Q9EPQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr1Q9EPQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr1Q9EPQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr1Q9EPQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr1Q9EPQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr1Q9EPQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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