RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 TESCQ96BS2 214 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 MKS1Q9NXB0 559 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.41□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 A8MXK9 166 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 H3BSA7 217 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 HMGN4O00479 90 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 AP3D1O14617 1153 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 WNT9BO14905 357 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SERPINA5P05154 406 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ADH4P08319 380 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 NUDT17P0C025 328 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 PNMTP11086 282 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ECHS1P30084 290 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ALDH3B1P43353 468 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CAPZA2P47755 286 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CLDN17P56750 224 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 BAMBIQ13145 260 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CARM1Q86X55 608 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SCAIQ8N9R8 606 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CCDC63Q8NA47 563 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 OR4F5Q8NH21 305 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ST7LQ8TDW4 575 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 ZG16BQ96DA0 208 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 OR2M2Q96R28 347 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 DIRC2Q96SL1 478 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SYT3Q9BQG1 590 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 BEX1Q9HBH7 125 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 DECR2Q9NUI1 292 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD4-215ENST00000592911 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 COPEO14579 308 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 RIPK2O43353 540 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 PEX11AO75192 247 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 MFN2O95140 757 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 NDUFA7O95182 113 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 IGHMP01871 453 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF12P17014 697 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 SEC24CP53992 1094 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 RAB1AP62820 205 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 CASP8Q14790 479 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 PDCD1Q15116 288 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 MSMPQ1L6U9 139 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 LEG1Q6P5S2 330 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 C16orf87Q6PH81 154 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 SPICQ8N5J4 248 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM86BQ8N661 226 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 RAB8BQ92930 207 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 SLC38A4Q969I6 547 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 CITED1Q99966 193 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 GAL3ST1Q99999 423 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 MRI1Q9BV20 369 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 DUSP13Q9UII6 198 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD4-215ENST00000592911 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms