RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557595.1

AC243965.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC243965.1, Length 781 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC243965.1-201ENST00000557595 EFNB3Q15768 340 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 RNF220Q5VTB9 566 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 VHLLQ6RSH7 139 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 VRK2Q86Y07 508 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 TEX29Q8N6K0 151 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 TPD52L3Q96J77 140 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.65□□□□□ -0.06
AC243965.1-201ENST00000557595 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.65□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ARPC2O15144 300 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 OIP5O43482 229 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 MFN2O95140 757 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 WNT11O96014 354 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SERPINA1P01009 418 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 OPN1SWP03999 348 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 MSMBP08118 114 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 IFNA8P32881 189 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 COPZ1P61923 177 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CBFBQ13951 182 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 FLOT2Q14254 428 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ADIPOQQ15848 244 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CBLN3Q6UW01 205 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SMYD1Q8NB12 490 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 LAT2Q9GZY6 243 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 UPB1Q9UBR1 384 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 VWFP04275 2813 aa14.64□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 HKR1P10072 659 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SLC1A3P43003 542 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 DIO1P49895 249 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 TGFBR3Q03167 851 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 PDK3Q15120 406 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 MAPK14Q16539 360 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ASRGL1Q7L266 308 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZNF563Q8TA94 476 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SLC35B4Q969S0 331 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZG16BQ96DA0 208 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SLC6A7Q99884 636 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SELENONQ9NZV5 590 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.63□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CDHR4A6H8M9 788 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CFAP73A6NFT4 308 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SULT2B1O00204 365 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 AP3D1O14617 1153 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 GPR171O14626 319 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 BCL10O95999 233 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CRYAAP02489 173 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 SELENOWP63302 87 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 CASP12Q6UXS9 341 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 OR51F2Q8NH61 342 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 OR5W2Q8NH69 310 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 GPR119Q8TDV5 335 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 TMEM234Q8WY98 164 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 TAMM41Q96BW9 452 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 ESM1Q9NQ30 184 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.62□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.61□□□□□ -0.07
AC243965.1-201ENST00000557595 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms