RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CBR1	P16152	277 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPS1L1	P21108	318 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ACHE	P22303	614 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCR1	P25024	350 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GCA	P28676	217 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ARR3	P36575	388 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFIP2	P53365	341 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MYBPC1	Q00872	1141 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GNA13	Q14344	377 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IL23R	Q5VWK5	629 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	KANK2	Q63ZY3	851 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CARM1	Q86X55	608 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	AGR3	Q8TD06	166 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB8B	Q92930	207 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ROPN1L	Q96C74	230 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	BOD1	Q96IK1	185 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	POLE3	Q9NRF9	147 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OXSM	Q9NWU1	459 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MID2	Q9UJV3	735 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		9.31	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM129	A0AVI4	362 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPT2	A6NK58	231 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP7P3	A6NL99	342 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM233	B4DJY2	109 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PRODH	O43272	600 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PLIN3	O60664	434 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	UPK3A	O75631	287 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP5	O95183	116 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV3-15	P01624	115 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD2	P08910	425 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	COL8A2	P25067	703 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	FPR2	P25090	351 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH3B1	P43353	468 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K6	P52564	334 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM33	P57088	247 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CNPY4	Q8N129	248 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NANP	Q8TBE9	248 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MGARP	Q8TDB4	240 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	COQ8B	Q96D53	544 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT3	Q9BQG1	590 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY30	Q9C005	99 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PIF1	Q9H611	641 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	NOX3	Q9HBY0	568 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		9.3	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TG	P01266	2768 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPM1	405 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPW3	197 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP73	A6NFT4	308 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	COPE	O14579	308 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC43A1	O75387	559 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MPZL1	O95297	269 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRM4	P08173	479 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRA2C	P18825	462 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GALK2	Q01415	458 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MDP1	Q86V88	176 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	CADM2	Q8N3J6	435 aa		9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
SKAP2-209	ENST00000497511	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		9.29	□□□□□ -0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96 ms