RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 SNTA1Q13424 505 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CD226Q15762 336 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF141Q15928 474 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KLHL26Q53HC5 615 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CBLN3Q6UW01 205 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 AQP11Q8NBQ7 271 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF217Q8TC41 542 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 UBE2FQ969M7 185 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF524Q96C55 264 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 FUZQ9BT04 418 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KRT84Q9NSB2 600 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KIF17Q9P2E2 1029 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SERINC4A6NH21 518 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 AP3D1O14617 1153 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OR10H3O60404 316 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZIC3O60481 467 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 HPRP00739 348 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF708P17019 499 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CHMP24386 653 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CCKARP32238 428 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GSSP48637 474 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PTH2RP49190 550 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PCYT1AP49585 367 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 FGFBP1Q14512 234 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OR1Q1Q15612 314 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 RNF220Q5VTB9 566 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF550Q7Z398 422 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MARCH3Q86UD3 253 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 IGFBPL1Q8WX77 278 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PRRC1Q96M27 445 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GPA33Q99795 319 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 Q9H521 79 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 C8orf4Q9NR00 106 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 BATF3Q9NR55 127 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC7A7Q9UM01 511 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A087WUU8 490 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 A0A1W2PRQ8 180 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TSPAN2O60636 221 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CSTAP01040 98 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 HPGDP15428 266 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 IL12BP29460 328 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SRD5A2P31213 254 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CLDN15P56746 228 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MYBPC1Q00872 1141 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 DGCR6Q14129 220 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PMM1Q92871 262 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 SFXN2Q96NB2 322 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 MED18Q9BUE0 208 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GSX2Q9BZM3 304 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CARD8Q9Y2G2 431 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TTC36A6NLP5 189 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TO15178 435 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CGAP01215 116 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CRHP06850 196 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 LYNP07948 512 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 GUSBP08236 651 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 CBLP22681 906 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 UGT2B10P36537 528 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 NPRL3Q12980 569 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 USP51Q70EK9 711 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTA-204ENST00000558376 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms