RNA–Protein interactions for RNA: YMR136W

GAT2, Transcript of Protein containing GATA family zinc finger motifs, yeast

Gene GAT2, Length 1,683 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAT2	YMR136W	SVS1	Q12254	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YVC1	Q12324	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	DPH6	Q12429	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	TRK2	P28584	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RPC82	P32349	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SFA1	P32771	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	PTH2	P34222	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SAP190	P36123	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	DCS2	Q12123	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SEC65	P29478	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	STE13	P33894	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	ACA1	P39970	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	EMP65	P40085	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	QRI7	P43122	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RSC58	Q07979	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RSB1	Q08417	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YFL052W	P43551	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	BUD9	P53226	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YML131W	Q03102	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	PRC1	P00729	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RSC6	P25632	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SSH4	P32343	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	ERR3	P42222	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	BNA2	P47125	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	ARP4	P80428	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	PSR2	Q07949	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	THI21	Q08975	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RPN12	P32496	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	MDL2	P33311	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	MAL31	P38156	614 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	AIM21	P40563	679 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	ZIP2	P53061	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	HIM1	Q06674	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
GAT2	YMR136W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SRP101	P32916	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	YKR018C	P36114	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	FLR1	P38124	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	SAP185	P40856	1058 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	HPF1	Q05164	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	CIA1	Q05583	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GAT2	YMR136W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	EAF5	P39995	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	UBA2	P52488	636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	YNR014W	P53719	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	ENT2	Q05785	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	NSI1	Q12457	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	AI3	P03877	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	SWI6	P09959	803 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	APL1	P27351	700 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	BEM3	P32873	1128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	MMM1	P41800	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	PCL10	P53124	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	OMS1	Q06668	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	SSP2	Q08646	371 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	AIM26	P32858	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	POA1	P38218	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	PEX7	P39108	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	YIL092W	P40497	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAT2	YMR136W	PUS2	P53167	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 140.1 ms