RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SCM3	Q12334	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MSS18	P08593	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YER152C	P10356	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	EXO5	P38289	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PAN5	P38787	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	APE4	P38821	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	VPS30	Q02948	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ATP25	Q03153	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	LCD1	Q04377	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NUP192	P47054	1683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ADE8	P04161	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RPS1B	YML063W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RPS1B	YML063W	RAD18	P10862	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ANP1	P32629	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YKL100C	P34248	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	VPS8	P39702	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RAD26	P40352	1085 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MPH1	P40562	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	QRI7	P43122	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NPY1	P53164	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	DAM1	P53267	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SKY1	Q03656	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PEX15	Q08215	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MCA1	Q08601	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SPO21	Q12411	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SSM4	P40318	1319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RPS1B	YML063W	PXA2	P34230	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ADD66	P36040	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RGD1	P38339	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	BCD1	P38772	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	MEP3	P53390	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	VHS3	Q08438	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GNT1	Q12096	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NHA1	Q99271	985 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	PDR11	P40550	1411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HOM3	P10869	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ENA1	P13587	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HOG1	P32485	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NPL6	P32832	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	XRS2	P33301	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	CAJ1	P39101	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	YML6	P51998	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	TIM50	Q02776	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	BLS1	Q06071	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	RSC2	Q06488	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	GLO4	Q12320	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS1B	YML063W	HOP1	P20050	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BEM3	P32873	1128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PRK1	P40494	810 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	PRY1	P47032	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	BNA1	P47096	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RSC1	P53236	928 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	HOL1	P53389	586 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GTR1	Q00582	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	AOS1	Q06624	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	RSC3	Q06639	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	APM4	Q99186	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	FUS1	P11710	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	MSH1	P25846	959 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	NGG1	P32494	702 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS1B	YML063W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.1 ms