RNA–Protein interactions for RNA: YLR093C

NYV1, Transcript of v-SNARE component of the vacuolar SNARE complex, yeast

Gene NYV1, Length 762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NYV1	YLR093C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	EMC3	P36039	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	SIC1	P38634	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	SNM1	P40993	198 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	NRG1	Q03125	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	EAF1	Q06337	982 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	TDP1	P38319	544 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	PCL5	P38794	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	SSY5	P47002	699 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	UBX5	Q06682	500 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	SGO1	Q08490	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	THI21	Q08975	551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	FMP52	P40008	231 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	PFA3	P42836	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	TAH11	P47112	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	CDC43	P18898	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	DAL7	P21826	554 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	SAK1	P38990	1142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	IRC13	Q08630	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	GPR1	Q12361	961 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NYV1	YLR093C	BNR1	P40450	1375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	PRC1	P00729	532 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TOP3	P13099	656 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TAD1	P53065	400 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	IMO32	P53219	342 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	DAM1	P53267	343 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	COQ11	Q05892	277 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	RSC3	Q06639	885 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	REH1	Q06709	432 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TGL5	Q12043	749 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	KIN3	P22209	435 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ARE1	P25628	610 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YIL166C	P40445	542 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	HOS4	P40480	1083 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	GYP8	P43570	497 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TEL2	P53038	688 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	SSL2	Q00578	843 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YCL002C	P25565	263 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	PPZ2	P33329	710 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	BCD1	P38772	366 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	BAP3	P41815	604 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	UBC11	P52492	156 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	DMC1	P25453	334 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YBR259W	P38338	688 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ECM1	P39715	212 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YAP1802	P53309	568 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ASM4	Q05166	528 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	CIT1	P00890	479 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ADY2	P25613	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	PEX2	P32800	271 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TAF8	Q03750	510 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	TAF3	Q12297	353 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	SIR3	P06701	978 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	RAD4	P14736	754 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	SAP190	P36123	1033 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	FLO10	P36170	1169 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ATP25	Q03153	612 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	ARO10	Q06408	635 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NYV1	YLR093C	HIR1	P32479	840 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	HUL4	P40985	892 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	ZIP2	P53061	704 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	ALG2	P43636	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	HXT16	P47185	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	REV7	P38927	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	YJL206C	P39529	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	YJL049W	P47048	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NYV1	YLR093C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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