RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	RPN4	Q03465	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	ESC2	Q06340	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	OPI10	Q08202	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	KAR4	P25583	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	MNN1	P39106	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YEN1	P40028	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YKE2	P52553	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YNL058C	P53947	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	SFB2	P53953	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	UPC2	Q12151	913 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	CEX1	Q12453	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	FOB1	O13329	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	NPP2	P39997	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	IRR1	P40541	1150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	BUD6	P41697	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	PHM6	Q05637	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	STE5	P32917	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	SAS3	P34218	831 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YPT53	P36019	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	MOH1	P38191	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	UBA2	P52488	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YGR021W	P53212	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	ATG16	Q03818	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SRB5	YGR104C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SRB5	YGR104C	YHR218W	P38899	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	TIM44	Q01852	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	OMS1	Q06668	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	IRC3	Q06683	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	GRC3	Q07845	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRB5	YGR104C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MSM1	P22438	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MRC1	P25588	1096 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	JNM1	P36224	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	TIM54	P47045	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YJL049W	P47048	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RRI2	Q12348	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	STE14	P32584	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	ANP1	P32629	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	STE13	P33894	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	NPR3	P38742	1146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	VID27	P40157	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PEX8	P53248	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	FOL1	P53848	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RNT1	Q02555	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	VTI1	Q04338	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CDC45	Q08032	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	APC5	Q08683	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	LAS17	Q12446	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CHD1	P32657	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	INH1	P01097	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	MTC2	P34246	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PAF1	P38351	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SUL1	P38359	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	APE4	P38821	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	BUL1	P48524	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	LCD1	Q04377	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RTP1	Q12751	981 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SAC3	P46674	1301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RAD4	P14736	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PIM1	P36775	1133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YRO2	P38079	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	IES5	P40060	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	PSR1	Q07800	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	SLX4	Q12098	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	ACF2	Q12168	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	HOM3	P10869	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRB5	YGR104C	RKM3	P38222	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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