RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601356.1

AP2A1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit alpha 1, human

Gene AP2A1, Length 2,238 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		27.89	■■■□□ 2.06
AP2A1-208	ENST00000601356	ME3	Q16798	604 aa		27.89	■■■□□ 2.06
AP2A1-208	ENST00000601356	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
AP2A1-208	ENST00000601356	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		27.89	■■■□□ 2.06
AP2A1-208	ENST00000601356	STRN4	Q9NRL3	753 aa		27.89	■■■□□ 2.06
AP2A1-208	ENST00000601356	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	IL2RB	P14784	551 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	GJB2	P29033	226 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	NECAB1	Q8N987	351 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		27.88	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		27.87	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		27.87	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.87	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	JCAD	Q9P266	1359 aa		27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ESPN	B1AK53	854 aa		27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	TAF5L	O75529	589 aa		27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	F13A1	P00488	732 aa		27.84	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CLCN1	P35523	988 aa		27.84	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.84	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF609	O15014	1411 aa		27.84	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	PSMA5	P28066	241 aa		27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	RNF20	Q5VTR2	975 aa		27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	HAUS7	Q99871	368 aa		27.83	■■■□□ 2.05
AP2A1-208	ENST00000601356	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		27.82	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		27.82	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		27.82	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	MTMR6	Q9Y217	621 aa		27.82	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.81	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	RPS6KB1	P23443	525 aa		27.8	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	EVA1C	P58658	441 aa		27.8	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.8	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TIMM10	P62072	90 aa		27.79	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.79	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.79	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		27.78	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	FIBP	O43427	364 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	RNF214	Q8ND24	703 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.76	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		27.76	■■■□□ 2.04
AP2A1-208	ENST00000601356	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	GOLIM4	O00461	696 aa		27.75	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.75	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		27.75	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		27.74	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	EYA2	O00167	538 aa		27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	TSPY26P	Q9H489	355 aa		27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	STK3	Q13188	491 aa		27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	ANKRD1	Q15327	319 aa		27.73	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		27.72	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.72	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		27.72	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		27.72	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	CYP21A2	P08686	494 aa		27.71	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	UBE2H	P62256	183 aa		27.71	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		27.71	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.71	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
AP2A1-208	ENST00000601356	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	PIGB	Q92521	554 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356		A0A1B0GUL7	405 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	KRT32	Q14532	448 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	FERMT3	Q86UX7	667 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		27.69	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	PHF14	O94880	888 aa		27.68	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		27.68	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		27.67	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	LAMA4	Q16363	1823 aa		27.67	■■■□□ 2.02
AP2A1-208	ENST00000601356	CIAO1	O76071	339 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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