RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	SLC51A	Q86UW1	340 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	CASP7	P55210	303 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	SP8	Q8IXZ3	490 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	TAF1	P21675	1872 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	CTSW	P56202	376 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	PSMD1	Q99460	953 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.89	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	TMC4	Q7Z404	712 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	COL4A1	P02462	1669 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	GRM8	O00222	908 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GPS1-222	ENST00000583983	MPND	Q8N594	471 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	GREM2	Q9H772	168 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	MYH3	P11055	1940 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	CSF1R	P07333	972 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	FOXO4	P98177	505 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	KIF16B	Q96L93	1317 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	UTY	O14607	1347 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	BCAR3	O75815	825 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-222	ENST00000583983	GPSM2	P81274	684 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	ITGA6	P23229	1130 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	COL4A5	P29400	1685 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	FZD9	O00144	591 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	AOC3	Q16853	763 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	KIF3C	O14782	793 aa		27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.7	■■■□□ 2.03
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM27	P14373	513 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-222	ENST00000583983	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02

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