RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRCP08575 1304 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 H7C1W4 665 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 TOMM70O94826 608 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 GCKRQ14397 625 aa20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 ALDH1L1O75891 902 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 KIF3CO14782 793 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 PRELPP51888 382 aa20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 NIM1KQ8IY84 436 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 EYA3Q99504 573 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 RRAGCQ9HB90 399 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.36■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 UTRNP46939 3433 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 CTSWP56202 376 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.35■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 LAMB2P55268 1798 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 PPIP5K2O43314 1243 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 BEND3Q5T5X7 828 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 OLFM4Q6UX06 510 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 RTL9Q8NET4 1388 aa20.34■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 FZD9O00144 591 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 FSTL1Q12841 308 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.33■□□□□ 0.85
RNPS1-208ENST00000563857 SNED1Q8TER0 1413 aa20.33■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 GPC2Q8N158 579 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.32■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 F6X3S4 739 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.31■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 GRM8O00222 908 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 WASHC4Q2M389 1173 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.3■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 C6orf229H3BNL8 230 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 CSF1RP07333 972 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 TNIP1Q15025 636 aa20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 G3V3G9 751 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 GGA1Q9UJY5 639 aa20.28■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 XDHP47989 1333 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 WDR90Q96KV7 1748 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ATP2B4P23634 1241 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 CASP7P55210 303 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 AOC3Q16853 763 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 HACL1Q9UJ83 578 aa20.27■□□□□ 0.84
RNPS1-208ENST00000563857 KIF16BQ96L93 1317 aa20.27■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 GPSM2P81274 684 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 GREM2Q9H772 168 aa20.26■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 HSPA6P17066 643 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 ITGA6P23229 1130 aa20.25■□□□□ 0.83
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.25■□□□□ 0.83
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