RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.35■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.35■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 VPS33BQ9H267 617 aa18.35■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-230ENST00000551968 SLC10A3P09131 477 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 TNIP1Q15025 636 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 CCDC102AQ96A19 550 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 H7C1D1 291 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 MYL6BP14649 208 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 MPNDQ8N594 471 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 PSMD14O00487 310 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 SP8Q8IXZ3 490 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 NLRP3Q96P20 1036 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 COL4A1P02462 1669 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 TBC1D8O95759 1140 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 DPF2Q92785 391 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-230ENST00000551968 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 CDCA5Q96FF9 252 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 RTL9Q8NET4 1388 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 SCN9AQ15858 1988 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 BBOX1O75936 387 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 HTTP42858 3142 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 MOB2Q70IA6 237 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 GCC1Q96CN9 775 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 GGA3Q9NZ52 723 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 RIMBP2O15034 1052 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 PARP10Q53GL7 1025 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 ZNF428Q96B54 188 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 GRAPQ13588 217 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 DOK7Q18PE1 504 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-230ENST00000551968 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 ANXA1P04083 346 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 PDIA6Q15084 440 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 WASHC4Q2M389 1173 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 PROSER3Q2NL68 480 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 SULF1Q8IWU6 871 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 POLLQ9UGP5 575 aa18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 POTEFA5A3E0 1075 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 GPR25O00155 361 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 ECE2O60344 883 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 CENPFP49454 3210 aa18.19■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 BRCA2P51587 3418 aa18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 GPSM2P81274 684 aa18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 NLRP10Q86W26 655 aa18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.17■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CS-230ENST00000551968 SCARF1Q14162 830 aa18.16■□□□□ 0.5
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