RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 ANXA1P04083 346 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 MMP10P09238 476 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 FLIIQ13045 1269 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PROSER3Q2NL68 480 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PARP10Q53GL7 1025 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 SMIM5Q71RC9 77 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PTPRCP08575 1304 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 KIF16BQ96L93 1317 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 ATP10DQ9P241 1426 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TK2O00142 265 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 ST5P78524 1137 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 NFIXQ14938 502 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 KSR2Q6VAB6 950 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 SERPINB2P05120 415 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TM4SF1P30408 202 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 TCIRG1Q13488 830 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 HLFQ16534 295 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PLPP6Q8IY26 295 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 CNBD1Q8NA66 436 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-210ENST00000547912 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 MS4A1P11836 297 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 GPTP24298 496 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 PDE6BP35913 854 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 MYD88Q99836 296 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 TGFB2P61812 414 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 G2E3Q7L622 706 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 LINS1Q8NG48 757 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 HCSTQ9UBK5 93 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ADCY9O60503 1353 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 FAM177BA6PVY3 158 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 H0YIN7 160 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 DDR1Q08345 913 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 NLRP10Q86W26 655 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 NLRP3Q96P20 1036 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-210ENST00000547912 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms