RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-208ENST00000547298 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-208ENST00000547298 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-208ENST00000547298 DPF2Q92785 391 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-208ENST00000547298 TBC1D8O95759 1140 aa15.2■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 SP8Q8IXZ3 490 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 NGEFQ8N5V2 710 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 NUP98P52948 1817 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 PSMD14O00487 310 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 MPNDQ8N594 471 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 POTEFA5A3E0 1075 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 MCM10Q7L590 875 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 NLRP3Q96P20 1036 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 GPR25O00155 361 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 BBOX1O75936 387 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 CDCA5Q96FF9 252 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 RTL9Q8NET4 1388 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 DCTN1Q14203 1278 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.15■□□□□ 0.02
CS-208ENST00000547298 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 PRKAR2BP31323 418 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 MOB2Q70IA6 237 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 GGA3Q9NZ52 723 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 HTTP42858 3142 aa15.14■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 TM4SF4P48230 202 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 SULF1Q8IWU6 871 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 FKBP1BP68106 108 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 GRAPQ13588 217 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 BRCA2P51587 3418 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 FKTNO75072 461 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 MYL6BP14649 208 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 PARP10Q53GL7 1025 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 SZT2Q5T011 3432 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 WASHC4Q2M389 1173 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 POLLQ9UGP5 575 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 LAMB2P55268 1798 aa15.08■□□□□ 0.01
CS-208ENST00000547298 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.08■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 DLL1O00548 723 aa15.08■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.08■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 RIMBP2O15034 1052 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 ECE2O60344 883 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 EN2P19622 333 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 SCARF1Q14162 830 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 DOK7Q18PE1 504 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 TAF1P21675 1872 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 CENPFP49454 3210 aa15.07■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 COL4A1P02462 1669 aa15.06■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.06■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 OTUD5Q96G74 571 aa15.06■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 SCN9AQ15858 1988 aa15.05■□□□□ 0
CS-208ENST00000547298 GPSM2P81274 684 aa15.05■□□□□ -0
CS-208ENST00000547298 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms