RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545825.1

CCDC189-211, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC189, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-211ENST00000545825 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
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CCDC189-211ENST00000545825 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 TAF1P21675 1872 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 COL4A1P02462 1669 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 BEND3Q5T5X7 828 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 SP8Q8IXZ3 490 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC189-211ENST00000545825 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
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CCDC189-211ENST00000545825 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.63■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.62■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.62■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 CASP7P55210 303 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 TMC4Q7Z404 712 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 CTSWP56202 376 aa28.6■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.6■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 GLTPD2A6NH11 291 aa28.59■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 KIF3CO14782 793 aa28.59■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.59■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 PTPRCP08575 1304 aa28.59■■■□□ 2.17
CCDC189-211ENST00000545825 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.58■■■□□ 2.17
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CCDC189-211ENST00000545825 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.57■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.57■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.57■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 COL4A5P29400 1685 aa28.55■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 ALDH1L1O75891 902 aa28.55■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 MPNDQ8N594 471 aa28.55■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.54■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.54■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 GREM2Q9H772 168 aa28.54■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 MYH3P11055 1940 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 RTL9Q8NET4 1388 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 C1QTNF8P60827 252 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 RRAGCQ9HB90 399 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 GRM8O00222 908 aa28.52■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.52■■■□□ 2.16
CCDC189-211ENST00000545825 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 FZD9O00144 591 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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CCDC189-211ENST00000545825 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 JDP2Q8WYK2 163 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 PPIP5K2O43314 1243 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 CSF1RP07333 972 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 VPS33BQ9H267 617 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 GPSM2P81274 684 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 AOC3Q16853 763 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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CCDC189-211ENST00000545825 WDR90Q96KV7 1748 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 FOXO4P98177 505 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 POTECB2RU33 542 aa28.47■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 FAM161AQ3B820 660 aa28.47■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
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CCDC189-211ENST00000545825 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.46■■■□□ 2.15
CCDC189-211ENST00000545825 TOMM70O94826 608 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 ITGA6P23229 1130 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 NIM1KQ8IY84 436 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 POLLQ9UGP5 575 aa28.45■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 UTYO14607 1347 aa28.44■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.43■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 C6orf229H3BNL8 230 aa28.42■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
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CCDC189-211ENST00000545825 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 GPC2Q8N158 579 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 KAZALD1Q96I82 304 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 SUCLG2Q96I99 432 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 SPEF2Q9C093 1822 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 KIF16BQ96L93 1317 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CCDC189-211ENST00000545825 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.4■■■□□ 2.14
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