RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 NIM1KQ8IY84 436 aa36.89■■■■□ 3.5
ACER3-214ENST00000534206 CNTROBQ8N137 903 aa36.89■■■■□ 3.5
ACER3-214ENST00000534206 C8orf58Q8NAV2 365 aa36.89■■■■□ 3.5
ACER3-214ENST00000534206 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
ACER3-214ENST00000534206 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 CNTNAP1P78357 1384 aa36.88■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 DUOX1Q9NRD9 1551 aa36.87■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 GNAI1P63096 354 aa36.87■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 CXCL9Q07325 125 aa36.87■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 MPNDQ8N594 471 aa36.87■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.85■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 ZNRF3Q9ULT6 936 aa36.85■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.85■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 KIAA2012Q0VF49 1180 aa36.84■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 SUPT20HQ8NEM7 779 aa36.84■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
ACER3-214ENST00000534206 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 TSPYL6Q8N831 410 aa36.81■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 GPRC5DQ9NZD1 345 aa36.8■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 YDJCA8MPS7 323 aa36.79■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 VEGFBP49765 207 aa36.78■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 TMC4Q7Z404 712 aa36.78■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 RIC3Q7Z5B4 369 aa36.78■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
ACER3-214ENST00000534206 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 RAD17O75943 681 aa36.74■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 GOLGA2Q08379 1002 aa36.74■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 MYD88Q99836 296 aa36.74■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 RASSF10A6NK89 507 aa36.73■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 CIAPIN1Q6FI81 312 aa36.73■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 POLLQ9UGP5 575 aa36.73■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 GPSM2P81274 684 aa36.72■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 CCDC27Q2M243 656 aa36.71■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 SEC31BQ9NQW1 1179 aa36.71■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 TRAF5O00463 557 aa36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 CST9Q5W186 159 aa36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 CCDC191Q8NCU4 936 aa36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
ACER3-214ENST00000534206 SHTN1A0MZ66 631 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 RPS8P62241 208 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 CCDC30Q5VVM6 783 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 WWC1Q8IX03 1113 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 PGAP2Q9UHJ9 254 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 FOXN1O15353 648 aa36.67■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.67■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 TNIP1Q15025 636 aa36.66■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 WASHC4Q2M389 1173 aa36.66■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 CDHR2Q9BYE9 1310 aa36.65■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 KCNQ5Q9NR82 932 aa36.65■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 IGKV5-2P06315 115 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 DBNDD1Q9H9R9 158 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-214ENST00000534206 RIMBP2O15034 1052 aa36.63■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 TNS4Q8IZW8 715 aa36.63■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 TBC1D16Q8TBP0 767 aa36.63■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 WBP1LQ9NX94 342 aa36.63■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 G2E3Q7L622 706 aa36.62■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 PODXL2Q9NZ53 605 aa36.62■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 C6orf229H3BNL8 230 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 PSMD14O00487 310 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 PDE8AO60658 829 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 KSR2Q6VAB6 950 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 BCL2L13Q9BXK5 485 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 RTL9Q8NET4 1388 aa36.61■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 PI4KAP2A4QPH2 592 aa36.6■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa36.6■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 DDX58O95786 925 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 SCN9AQ15858 1988 aa36.58■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 DOK7Q18PE1 504 aa36.58■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
ACER3-214ENST00000534206 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
ACER3-214ENST00000534206 DPF2Q92785 391 aa36.57■■■■□ 3.44
ACER3-214ENST00000534206 CHMP4AQ9BY43 222 aa36.57■■■■□ 3.44
ACER3-214ENST00000534206 IL16Q14005 1332 aa36.57■■■■□ 3.44
ACER3-214ENST00000534206 ECE2O60344 883 aa36.56■■■■□ 3.44
ACER3-214ENST00000534206 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.6 ms