RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.37■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 NLRP3Q96P20 1036 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.36■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 RTL9Q8NET4 1388 aa27.35■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.35■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 FBXO3Q9UK99 471 aa27.35■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 DDR1Q08345 913 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.34■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 FAM161AQ3B820 660 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 ABCC12Q96J65 1359 aa27.33■■□□□ 1.97
ACER3-202ENST00000525194 MMP10P09238 476 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 ITGA6P23229 1130 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 GREM2Q9H772 168 aa27.32■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 APBB1O00213 710 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 CIAO1O76071 339 aa27.3■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 MSL1Q68DK7 614 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 LNPKQ9C0E8 428 aa27.29■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 SIL1Q9H173 461 aa27.28■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.27■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 EYA2O00167 538 aa27.27■■□□□ 1.96
ACER3-202ENST00000525194 ILDR2Q71H61 639 aa27.26■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.25■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.24■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.24■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 RGS3P49796 1198 aa27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.23■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 SASH1O94885 1247 aa27.22■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 PDE6BP35913 854 aa27.22■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 CRY2Q49AN0 593 aa27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 CASZ1Q86V15 1759 aa27.21■■□□□ 1.95
ACER3-202ENST00000525194 PDE4AP27815 886 aa27.2■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 MTFR1LQ9H019 292 aa27.2■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.2■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.2■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 LRRC24Q50LG9 513 aa27.19■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 GPR108Q9NPR9 543 aa27.19■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.18■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.18■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 LRP5O75197 1615 aa27.18■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 POLD1P28340 1107 aa27.17■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 TFCP2Q12800 502 aa27.17■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 BCL11AQ9H165 835 aa27.17■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.17■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 METTL24Q5JXM2 366 aa27.16■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 SKAP1Q86WV1 359 aa27.15■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 GRAPQ13588 217 aa27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 AACSQ86V21 672 aa27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 GPATCH3Q96I76 525 aa27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.14■■□□□ 1.94
ACER3-202ENST00000525194 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.13■■□□□ 1.93
ACER3-202ENST00000525194 ZBTB7AO95365 584 aa27.13■■□□□ 1.93
ACER3-202ENST00000525194 NPR1P16066 1061 aa27.13■■□□□ 1.93
ACER3-202ENST00000525194 TNNI3KQ59H18 835 aa27.13■■□□□ 1.93
ACER3-202ENST00000525194 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
ACER3-202ENST00000525194 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.13■■□□□ 1.93
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