RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 SP8Q8IXZ3 490 aa14.99□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.99□□□□□ -0.01
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RNF4-218ENST00000513284 TNIP1Q15025 636 aa14.98□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 MICALL2Q8IY33 904 aa14.98□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 MPNDQ8N594 471 aa14.98□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.98□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 CCDC102AQ96A19 550 aa14.98□□□□□ -0.01
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RNF4-218ENST00000513284 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RNF4-218ENST00000513284 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.98□□□□□ -0.01
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RNF4-218ENST00000513284 BBOX1O75936 387 aa14.97□□□□□ -0.01
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RNF4-218ENST00000513284 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.94□□□□□ -0.02
RNF4-218ENST00000513284 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.94□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RNF4-218ENST00000513284 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.93□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 PARP10Q53GL7 1025 aa14.92□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RNF4-218ENST00000513284 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.92□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 TAF1P21675 1872 aa14.92□□□□□ -0.02
RNF4-218ENST00000513284 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.91□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 TBC1D8O95759 1140 aa14.9□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
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RNF4-218ENST00000513284 PROSER3Q2NL68 480 aa14.88□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.87□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 HTTP42858 3142 aa14.87□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.86□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 GCC1Q96CN9 775 aa14.86□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 SULF1Q8IWU6 871 aa14.85□□□□□ -0.03
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RNF4-218ENST00000513284 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.85□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 CENPFP49454 3210 aa14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 GPR25O00155 361 aa14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 SCARF1Q14162 830 aa14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RNF4-218ENST00000513284 ERBB4Q15303 1308 aa14.84□□□□□ -0.03
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