RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNP2	Q05952	138 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIN2C	Q14957	1233 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMC4	Q7Z404	712 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NLRP13	Q86W25	1043 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BACH2	Q9BYV9	841 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CNTN3	Q9P232	1028 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SORBS3	O60504	671 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RECK	O95980	971 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGA6	P23229	1130 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IRS1	P35568	1242 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCIN	Q13939	588 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PI16	Q6UXB8	463 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784		Q6ZNB5	142 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FBF1	Q8TES7	1133 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PNMA5	Q96PV4	448 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GSX2	Q9BZM3	304 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHRD	Q9H2X0	955 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDC14C	A4D256	554 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EREG	O14944	169 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RARA	P10276	462 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TCF3	P15923	654 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CD33	P20138	364 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CES1	P23141	567 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GNA15	P30679	374 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPEM2	Q0P670	501 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MARK1	Q9P0L2	795 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZFAT	Q9P243	1243 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HCN2	Q9UL51	889 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPG7	Q9UQ90	795 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MMP20	O60882	483 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFKB1	P19838	968 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ITGAE	P38570	1179 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LAMC2	Q13753	1193 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BHMT	Q93088	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GMCL1	Q96IK5	515 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC30A3	Q99726	388 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NPHS2	Q9NP85	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AK5	Q9Y6K8	562 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPR25	O00155	361 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPFIA3	O75145	1194 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PMEPA1	Q969W9	287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POTEC	B2RU33	542 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LCE2B	O14633	110 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PSAP	P07602	524 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FGFR3	P22607	806 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR13H1	Q8NG92	308 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PHF24	Q9UPV7	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTSH	P09668	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTBS	Q01459	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEUROD1	Q13562	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SV2A	Q7L0J3	742 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BCO2	Q9BYV7	579 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGFLR1	Q9H665	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A1W2PP55	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GIPC1	O14908	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP3K6	O95382	1288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EDN3	P14138	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VEGFB	P49765	207 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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