RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 NRBP1Q9UHY1 535 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 COG6Q9Y2V7 657 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 TSPY26PQ9H489 355 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 RAB11FIP3O75154 756 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 WLSQ5T9L3 541 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 KAT2BQ92831 832 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 EXOC1Q9NV70 894 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 EPAS1Q99814 870 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 BICDL2A1A5D9 508 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 SPDL1Q96EA4 605 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP69A5D8W1 941 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 CEP135Q66GS9 1140 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 NACC2Q96BF6 587 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-216ENST00000507116 NAA25Q14CX7 972 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ERMNQ8TAM6 284 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 MKS1Q9NXB0 559 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-216ENST00000507116 ENO4A6NNW6 628 aa7.11□□□□□ -1.27
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