RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 GRAPQ13588 217 aa24.12■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.11■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 BEND3Q5T5X7 828 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.1■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 CTSWP56202 376 aa24.09■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.09■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.09■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.08■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 BBOX1O75936 387 aa24.08■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 SLC51AQ86UW1 340 aa24.08■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 H7C1W4 665 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 KIF16BQ96L93 1317 aa24.07■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 COL4A1P02462 1669 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 ALDH1L1O75891 902 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.06■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 GRM8O00222 908 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 PRELPP51888 382 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 TMC4Q7Z404 712 aa24.05■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.04■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 SP8Q8IXZ3 490 aa24.03■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 MPNDQ8N594 471 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 PSMD1Q99460 953 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 GREM2Q9H772 168 aa24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PITX1-204ENST00000504936 CASP7P55210 303 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.01■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 FAM161AQ3B820 660 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 SNED1Q8TER0 1413 aa24■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 PPIP5K2O43314 1243 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 BCAR3O75815 825 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.99■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 JDP2Q8WYK2 163 aa23.98■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 ITGA6P23229 1130 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.97■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 RTL9Q8NET4 1388 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 C6orf229H3BNL8 230 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 AOC3Q16853 763 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 NIM1KQ8IY84 436 aa23.96■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.95■■□□□ 1.43
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 SUCLG2Q96I99 432 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 LTBP1Q14766 1721 aa23.95■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 GPSM2P81274 684 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.94■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 A0A1B0GUL6 1792 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 GLTPD2A6NH11 291 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 FOXO4P98177 505 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.93■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 UFL1O94874 794 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 CSF1RP07333 972 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 COL4A5P29400 1685 aa23.92■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 EYA3Q99504 573 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 RRAGCQ9HB90 399 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 GGA1Q9UJY5 639 aa23.91■■□□□ 1.42
PITX1-204ENST00000504936 WDR90Q96KV7 1748 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.1 ms