RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TXNRD1	Q16881	649 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRC	P08575	1304 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TEF	Q10587	303 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC39A6	Q13433	755 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	DSG2	Q14126	1118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	NFKBIB	Q15653	356 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	GCC1	Q96CN9	775 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF2C	Q99661	725 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		7.25	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL9	O00512	1426 aa		7.24	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	C5	P01031	1676 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ANXA1	P04083	346 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP6V1A	P38606	617 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR20E	P86478	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR20C	P86479	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR20D	P86480	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR20B	P86481	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR20A	P86496	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	FLII	Q13045	1269 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	IL21	Q9HBE4	155 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		7.23	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SIK1	P57059	783 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PROSER3	Q2NL68	480 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	AAAS	Q9NRG9	546 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		7.22	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	APBB1	O00213	710 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R37	O75864	691 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP8B2	P98198	1209 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC22	Q5TAA0	569 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF790	Q6PG37	636 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM5	Q71RC9	77 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	STK32B	Q9NY57	414 aa		7.21	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ADCY9	O60503	1353 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ITPK1	Q13572	414 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC15A2	Q16348	729 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	LRCH3	Q96II8	777 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		7.2	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SDS	P20132	328 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	COL9A1	P20849	921 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	DDIT3	P35638	169 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	BEND3	Q5T5X7	828 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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