RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1328Q86T90 577 aa19.24■□□□□ 0.67
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNA2P51530 1060 aa19.21■□□□□ 0.67
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.2■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERLIN1O75477 346 aa19.2■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM5P33992 734 aa19.2■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHMLP26374 656 aa19.19■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNMO15061 1565 aa19.19■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA2P54652 639 aa19.19■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHDC4Q8TBB5 520 aa19.17■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F13A1P00488 732 aa19.17■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLTCL1P53675 1640 aa19.16■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.16■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN12O43309 604 aa19.16■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.16■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC102BQ68D86 513 aa19.16■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF3Q5VWG9 929 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALG1Q9BT22 464 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC25Q9H1X3 360 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO6Q9UM54 1294 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB43O43298 467 aa19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 698.7
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
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