RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TNS1-215	ENST00000480416	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SLIT3	O75094	1523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	RASSF7	Q02833	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ABCC6	O95255	1503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CNTNAP1	P78357	1384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SBF1	O95248	1867 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416		J3QL48	77 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM66	O15016	1216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SPTLC1	O15269	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MMP10	P09238	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	NDUFV2	P19404	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TGFB2	P61812	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CTH	P32929	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SKOR1	P84550	965 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	C5	P01031	1676 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CHRNA5	P30532	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	HPS1	Q92902	700 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	USP47	Q96K76	1375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SOX10	P56693	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SH3BP2	P78314	561 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PDE4D	Q08499	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MPND	Q8N594	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	BAP1	Q92560	729 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TRIM47	Q96LD4	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	SIAH2	O43255	324 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	WFS1	O76024	890 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	FBLN1	P23142	703 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	AGER	Q15109	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TNS1-215	ENST00000480416	NFAT5	O94916	1531 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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