RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		12.06	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335		H7C1W4	665 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	GRM8	O00222	908 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	CTSW	P56202	376 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ABCC4	O15439	1325 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	RASSF7	Q02833	373 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	SP8	Q8IXZ3	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	MPND	Q8N594	471 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	JDP2	Q8WYK2	163 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	SLX4	Q8IY92	1834 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	BCAR3	O75815	825 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	MS4A1	P11836	297 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
PKP4-208	ENST00000462335	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	KCNJ4	P48050	445 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	OLFM4	Q6UX06	510 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	EYA3	Q99504	573 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	GREM2	Q9H772	168 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	NFKBIE	O00221	500 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	PPIP5K2	O43314	1243 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	GNAI3	P08754	354 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ITGA6	P23229	1130 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	NIM1K	Q8IY84	436 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	PSMD1	Q99460	953 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	LAMB2	P55268	1798 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	PLIN1	O60240	522 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	UFL1	O94874	794 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CSF1R	P07333	972 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	TRIM27	P14373	513 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	MYH3	P11055	1940 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	XDH	P47989	1333 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	CASP7	P55210	303 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKP4-208	ENST00000462335	GPSM2	P81274	684 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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