RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452612.5

TTC28-AS1-217, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 746 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CFAP44Q96MT7 982 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CXCL9Q07325 125 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FAM89AQ96GI7 184 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 APAF1O14727 1248 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 FOXN1O15353 648 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ISCA1Q9BUE6 129 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 VPS33BQ9H267 617 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HYPKQ9NX55 129 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.86■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 COL4A1P02462 1669 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RASSF10A6NK89 507 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRAF5O00463 557 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RAD17O75943 681 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KIAA2012Q0VF49 1180 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF853P0CG23 659 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 AIDAQ96BJ3 306 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-217ENST00000452612 YDJCA8MPS7 323 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IFT57Q9NWB7 429 aa16.83■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GNAI1P63096 354 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GOLGA2Q08379 1002 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TMC4Q7Z404 712 aa16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SHTN1A0MZ66 631 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RIMBP2O15034 1052 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GRM1Q13255 1194 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TNIP1Q15025 636 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYD88Q99836 296 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WBP1LQ9NX94 342 aa16.81■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C6orf229H3BNL8 230 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GPSM2P81274 684 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 WASHC4Q2M389 1173 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CST9Q5W186 159 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 POLLQ9UGP5 575 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SCN9AQ15858 1988 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 LBX1P52954 281 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MICALL2Q8IY33 904 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CAPNS2Q96L46 248 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 PSMD14O00487 310 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 DOK7Q18PE1 504 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC184Q52MB2 194 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-217ENST00000452612 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.77■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SPEF2Q9C093 1822 aa16.77■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MYH3P11055 1940 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 H7C1D1 291 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ECE2O60344 883 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 ECE1P42892 770 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TSPYL6Q8N831 410 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 EYA3Q99504 573 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-217ENST00000452612 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms